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Sobre este item
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O advento de tecnologias de sequenciamento de última geração levou a uma enxurrada de conjuntos de dados em escala de genoma para organismos pertencentes a todos os domínios da árvore da vida. portanto, uma nova era começou onde namoro a árvore da vida usando dados em escala de genoma está agora ao nosso alcance. Neste protocolo, explicamos como usar o programa de computador MCMCTree para realizar inferência Bayesiana de tempos de divergência usando conjuntos de dados em escala de genoma.
Usamos uma filogenia de dez espécies de primatas, com um alinhamento molecular de mais de três milhões de pares de bases, como um exemplo de como realizar a análise. Prestamos atenção especial em como configurar a análise e os antecedentes e como diagnosticar o algoritmo MCMC usado para obter as estimativas posteriores de tempos de divergência e taxas de evolução. A Springer Nature está desenvolvendo uma nova ferramenta para encontrar e avaliar protocolos.
Saber mais. A hipótese do relógio molecular, que afirma que a taxa de evolução molecular é aproximadamente constante com o tempo, fornece uma maneira poderosa de estimar os tempos de divergência de espécies em uma filogenia. Diversas metodologias de inferência estatística foram desenvolvidas para relógio molecular namoro análises; Contudo, durante a última década, o método bayesiano surgiu como o método de escolha [ 4 , 5 ], e vários pacotes de software de inferência Bayesiana existem agora para realizar este tipo de análise [ 6 , 7 , 8 , 9 , 10 ].
Neste protocolo, vamos explicar como usar o programa de computador MCMCTree para estimar tempos de divergências de espécies usando conjuntos de dados em escala de genoma dentro da estrutura de inferência Bayesiana.
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Não tem uma conta ainda? Tire o máximo proveito da sua experiência com um passe de acesso total personalizado a tudo o que é local em eventos, música, restaurantes, notícias e mais. Jared Polis e seu parceiro de longa data, Marlon Reis, estão esperando seu primeiro bebê em setembro. Mas a mídia e o público não devem ter nenhuma expectativa sobre aprender mais detalhes. A dupla confirmou a história para o Denver Post , observando em um comunicado que eles estão “muito animados em se tornarem pais.
A Polis compartilhará informações no futuro?? Quando ele se tornou uma figura pública, ele não se autoidentificou como gay: Veja nosso perfil ”Young Blood ,”Publicado na época em que ele e Reis se conheceram, como ele confirmou no post de dezembro ”Jared Polis como Gay Standard Bearer. Assim sendo, ele provavelmente chegará à conclusão de que falar sobre sua crescente família em público não é apenas inevitável, mas é algo positivo para todos os envolvidos.
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