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方法は異なり、何を知っておくべきですか?
このアイテムについて
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進化ゲノミクスppCite as. 分子時計のベイズ法 デート 過去10年間で種の多様性が大幅に発達しました. この方法の利点には、系統樹の枝の進化速度の変化を説明するためのリラックスクロックモデルの使用、およびノード年齢の不確実性を説明するための柔軟な化石キャリブレーション密度の使用が含まれます。.
次世代シーケンシング技術の出現により、生命の木のすべてのドメインに属する生物のゲノム規模のデータセットが殺到しました。. したがって、, 新しい時代が始まった場所 デート ゲノムスケールのデータを使用した生命の木が手の届くところにあります. このプロトコルでは, コンピュータープログラムMCMCTreeを使用して、ゲノムスケールのデータセットを使用して発散時間のベイズ推定を実行する方法を説明します。.
10種の霊長類の系統発生を使用します, 300万塩基対以上の分子配列を持つ, 分析を実行する方法の模範として. 分析と事前確率の設定方法、および発散時間と進化速度の事後推定値を取得するために使用されるMCMCアルゴリズムの診断方法に特に注意を払います。. Springer Natureは、プロトコルを見つけて評価するための新しいツールを開発しています.
もっと詳しく知る. 分子時計の仮説, これは、分子進化の速度が時間とともにほぼ一定であると述べています, 系統発生における種の分岐の時間を推定するための強力な方法を提供します. 分子時計のためにいくつかの統計的推論方法論が開発されました デート 分析; しかしながら, 過去10年間, ベイジアン法が最適な方法として登場しました [ 4 , 5 ], そして、このタイプの分析を実行するために、いくつかのベイジアン推論ソフトウェアパッケージが現在存在しています。 [ 6 , 7 , 8 , 9 , 10 ].
このプロトコルでは, ベイズ推定フレームワーク内のゲノムスケールのデータセットを使用して、コンピュータープログラムMCMCTreeを使用して種の相違の時間を推定する方法を説明します。.
Reizen Talking AtomicWatch取扱説明書
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